Si, aunque el Messenger (Microsoft) como tal ha desaparecido, Facebook cuenta con su propio software para chatear, solo tienes que instalarlo y listo. Instale esta aplicación siguiendo estos pasos:
1° Haga clic en la tuerca de la barra de chat.
2° Haga clic en Chatear desde el escritorio de la computadora.

3° En la página de Messenger para Windows, haga clic en Instalar ahora.

4° En la ventana Guardar como, o dependiendo de su navegador, seleccione donde guardar y clic en Guardar.
5° Una vez descargado el instalador, haga doble clic en él y luego Ejecutar.
6° Espere mientras se instala el Messenger.
7° Una vez terminada la instalación aparecerá la ventana del chat de Facebook.

En la siguiente imagen estoy conversando con un amigo mediante el Messenger de Facebook.

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